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MST1R methylation as a diagnostic biomarker in renal cell tumors

2015; CIG Media Group; Linguagem: Português

10.1016/j.acup.2015.01.004

2387-0419

A. Luís, Francisco S. N. Lobo, Márcia Vieira‐Coimbra, Pedro Costa‐Pinheiro, Luís Antunes, Jorge Oliveira, Rui Henrique, Cármen Jerónimo,

Epigenetics and DNA Methylation

Renal cell tumors comprise both benign – oncocytoma – and malignant – clear cell renal cell carcinoma, papillary renal cell carcinoma, and chromophobe renal cell carcinoma – entities. Since the differential diagnosis among renal cell tumors is sometimes difficult on clinical, imaging and pathological grounds, and prognosis is quite dissimilar, epigenetic-based diagnostic biomarkers, specially promoter methylation, might be useful for accurate diagnosis and therapeutic planning. EpiTect Methyl II PCR Array was used to screen methylation status of 22 genes, involved in epithelial to mesenchymal transition. Quantitative real-time methylation specific polymerase chain reaction was performed for candidate gene validation, and methylation levels of renal cell tumors subtypes and normal kidney were determined and compared. MST1R promoter methylation level was significantly higher in clear cell renal cell carcinoma (median: 5367) compared to other renal cell tumors (median: papillary renal cell carcinoma – 1084, chromophobe renal cell carcinoma – 1023, oncocytoma – 1337) and normal kidney (median: 1125), allowing for accurate discrimination from other renal cell tumors with high sensitivity (>96.7%) and specificity (86.7%). Quantitative MST1R promoter methylation may be useful as biomarker for accurate diagnosis of clear cell renal cell carcinoma in problematic cases. Os tumores de células renais englobam neoplasias benignas – oncocitoma – e malignas – carcinoma de células renais de tipo célula clara, papilar e de células cromófobas. Uma vez que o diagnóstico diferencial entre eles não é linear do ponto de vista clínico, imagiológico e patológico, e que o prognóstico de cada subtipo é distinto, o desenvolvimento de biomarcadores de diagnóstico com base em alterações epigenéticas, nomeadamente a metilação do promotor de genes, poderá ser útil para o diagnóstico e planeamento do tratamento. A presença de metilação do promotor de 22 genes envolvidos na transição epitélio-mesênquima foi avaliada através da plataforma comercial EpiTectMethylIIPCR Array. Os resultados foram validados, no gene candidato, por “polymerase chain reaction” quantitativo em tempo real específico para metilação. Os níveis de metilação de cada tipo histológico de tumores de células renais e de tecido renal normal foram calculados e comparados. O nível de metilação do promotor do gene MST1R foi significativamente mais elevado nos carcinomas de células renais de tipo célula clara (mediana: 5.367) comparativamente com carcinomas de células renais papilares (mediana: 1.084), carcinomas de células renais de células cromófobas (mediana: 1.023), oncocitomas (mediana: 1.337) e rim normal (mediana: 1.125), permitindo identificar carcinomas de células renais de tipo célula clara com elevada sensibilidade (> 96,7%) e especificidade (86,7%). O nível de metilação do promotor do gene MST1R poderá constituir um biomarcador útil para o diagnóstico de carcinomas de células renais de tipo célula clara em casos problemáticos.