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HLA phenotype polymorphism in the lebanese population

1996; Elsevier BV; Volume: 3; Issue: 5 Linguagem: Francês

10.1016/s1246-7820(96)80019-x

1953-8022

Issam Mansour, S. Klaymé, Roger Naman, Jacques Loiselet, L. Hallé, C. Kaplan,

Monoclonal and Polyclonal Antibodies Research

The HLA-A, -B, -DR and DQ phenotypes have been defined in a panel of 217 Lebanese. These subjects were all unrelated, belonged to different religious communities and originated from the various provinces of Lebanon. All the broad class I specificities tested, except splits A25(10), B54(22) and B56(22), were present in this panel. When HLA-A and -B antigen frequencies were compared with data on the Caucasoids, Negroids and Orientals, several similarities in antigen frequencies could be found between some frequencies observed in the Lebanese and those observed in the Negroids and/or Orientals. There were no frequencies equivalent to those particular to the Caucasoids. In addition, two groups of class I antigens could be distinguished: a first group (A32, B14, B18, B35, B38, B39, B41 and B50) showing higher frequencies, and a second group (A31, B27, B60 and B62) showing lower frequencies than those observed in the Caucasoids, Negroids and Orientals. However, when analysed separately, several mediterranean ethnic groups, notably the Greeks and Italians, have a frequency profile equivalent to that of the Lebanese, with the exception of the B41 specificity, which is particularly high in the Lebanese (14.2 %). The data concerning the class II antigens are the most interesting. All the specificities were present in the panel. The HLA-DR5 is the highest frequency of DR antigens in the present panel (58.9 %) and nearly all DR5 positive individuals are DR11. The DR11 allele accounts for 33.1 % of the total DR gene frequency. The highest DQ antigen frequency is that of DQ3 (76.4 %), the majority of which is DQ7 (66.4 %). We observed a high DR11-DQ7 haplotype frequency (29.4 %) with a significant delta value for linkage disequilibrium. There is no linkage disequilibrium between B41 and DR11. The commonly observed linkage disequilibrium between the DQ5 allele, and the DR1, DR2, DR10 and DR14 alleles are not significant in this Lebanese panel. Les phénotypes HLA A, B, DR et DQ ont été étudiées dans un échantillonage de 217 Libanais. Les sujets ne sont pas apparentés et appartiennent aux différentes communautés religieuses. Leur origine géographique couvre l'ensemble du Liban. Exceptées les subdivisions comme A25(10), B54(22) et B56(22), toutes les spécificités étudiées en classe I sont présentes dans le panel. Les fréquences antigéniques ont été comparées avec les Caucasoïdes, Négroïdes, Mongoloïdes. Un premier groupe d'antigènes HLA classe I (A32, B14, B18, B35, B38, B39, B41 et B50) a une fréquence plus élevée que celle observée dans ces populations, alors qu'un deuxième groupe (A31, B27, B60 et B62) a une fréquence plus basse. Cependant, lorsque l'on compare les fréquences aux groupes ethniques méditerranéens notamment les Grecs et les Italiens, le profil antigénique est similaire excepté pour l'antigène B41 qui a une fréquence plus élevée chez les Libanais. Les résultats concernant les antigènes HLA classe II sont les plus intéressants. L'antigène HLA-DR5 est le plus représenté (58,9 %) et pratiquement tous les sujets DR5 sont DR11. L'allèle DR11 a une fréquence de 33,1 %. La fréquence la plus élévée au locus DQ est le DQ3 (76,4 %) dont la majorité des sujets sont DQ7 (66,4 %). Il existe un déséquilibre de liaison DR11-DQ7. Par contre, les déséquilibres de liaison observés habituellement entre DR1, DR2, DR10 et DR14 et DQ5 ne sont pas significatifs dans la population étudiée. En outre, nous n'avons pas trouvé de déséquilibre de liaison entre B41 et DR11.