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Artigo Acesso aberto Produção Nacional Revisado por pares

BIBTEX RIS

Projeto e implementação de uma ferramenta para o escalonamento de processos e acesso aos dados biológicos

2007; Instituto de Comunicação e Informação Científica e Tecnológica em Saúde (Icict) da Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz); Volume: 1; Issue: 2 Linguagem: Inglês

10.3395/reciis.v1i2.sup.99pt

1981-6286

Maíra Ferreira de Noronha, Sérgio Lifschitz,

Bioinformatics and Genomic Networks

This work discusses the implementation of BioProvider, a tool that efficiently provides data for biological applications. It uses ad-hoc buffer management policies and specific process scheduling control to deal with very large sequence data. We explain how to consider a non-intrusive approach in order to encourage the use of BioProvider in a transparent way while keeping the original applications unchanged. The first instantiation of BioProvider is tailored to BLAST, the most popular sequence comparison program.