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Variabilidade do gene da proteína capsidial de três espécies virais que infectam videiras no Brasil

2009; Springer Science+Business Media; Volume: 34; Issue: 5 Linguagem: Português

10.1590/s1982-56762009000500002

1983-2052

Paula Radaelli, T. V. M. Fajardo, Osmar Nickel, Marcelo Eiras, Gilvan Pio‐Ribeiro,

Plant Pathogenic Bacteria Studies

O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade de três vírus (Rupestris stem pitting-associated virus - RSPaV, Grapevine leafroll-associated virus 2 - GLRaV-2 e Grapevine fanleaf virus - GFLV) que infectam videiras no Brasil, através da caracterização molecular do gene da proteína capsidial (CP). Foram amplificados fragmentos que compreendem os genes completos da CP de nove isolados de RSPaV (780 pb), seis de GLRaV-2 (597 pb) e três de GFLV (1515 pb) por RT-PCR, utilizando-se oligonucleotídeos específicos para cada espécie viral. Os DNAs amplificados foram clonados e sequenciados. Os isolados de RSPaV foram reunidos em quatro grupos pela análise filogenética das sequências obtidas com valores de identidade de nucleotídeos (nt) que variaram de 81 a 99%. Para GLRaV-2, dois grupos foram definidos a partir das sequências de nt, com valores de identidade que variaram de 88 a 99% e, para GFLV, foram definidos dois grupos, com valores de identidade de nt que variaram de 89 a 98%. Os diferentes isolados das três espécies virais estudadas também foram detectados utilizando-se hibridização com sondas não-radioativas, marcadas com digoxigenina, possibilitando identificar de forma inequívoca as amostras infectadas, independentemente dos isolados virais empregados para síntese das sondas.