Artigo Acesso aberto Produção Nacional Revisado por pares

Dinâmica Molecular da Adenosina Deaminase de Edwardsiella tarda em Água - Tutorial Experimental

2015; UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAPÁ; Volume: 5; Issue: 4 Linguagem: Português

10.18561/2179-5746/biotaamazonia.v5n4p8-14

ISSN

2179-5746

Autores

Paulo Henrique Matayoshi Calixto, A.J. Ballarini, Cláudio Alberto Gellis de Mattos Dias, Júlio César Sá‐Oliveira,

Tópico(s)

Aquaculture disease management and microbiota

Resumo

A bacteria Gram-negativa Edwardsiella tarda e responsavel pela edwardisielose, uma doenca hemorragica de peixes, que conduz a grandes perdas economicas em todo o mundo. O conhecimento das moleculas envolvidas em processos bioquimicos de E. tarda e importante para o desenvolvimento de novos alvos terapeuticos e/ou profilaticos. Uma dessas moleculas e a adenosina deaminase, envolvida no processo de maturacao do tRNA, atraves da conversao de adenosina em inosina, ainda nao caracterizada em E. tarda. A caracterizacao de uma proteina e mais bem conduzida quando se conhece as suas particularidades estruturais. Uma das principais ferramentas de caracterizacao estrutural e a dinâmica molecular. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi de proporcionar um tutorial facilitado de dinâmica molecular utilizando o GROMACS, bem como, estabelecer a dinâmica molecular in silico da adenosina deaminase de E. tarda . Os dados gerados apontaram que a estrutura da adenosina deaminase e estavel, tanto do ponto de vista estrutural, quanto de enovelamento. O uso da dinâmica molecular pode auxiliar na escolha de novos alvos terapeuticos, sobretudo, no desenho racional de farmacos. Palavras-chave: Edwardsiella tarda , adenosina deaminase, dinâmica molecular, GROMACS, tutorial. Normal 0 21 false false false PT-BR X-NONE X-NONE

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