Produção Nacional
TRIAGEM VIRTUAL INVERSA COMO FERRAMENTA PARA A QUÍMICA DE PRODUTOS NATURAIS
2011; UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; Volume: 8; Issue: 1 Linguagem: Português
10.5216/ref.v8i1.10561
ISSN1808-0804
AutoresAna Paula Carregal, Alex Gutterres Taranto, Moacyr Comar, Luciana Alves Rodrigues dos Santos Lima, João Máximo de Siqueira,
Tópico(s)Biotechnology and Related Fields
ResumoA Triagem Virtual Inversa, ou Triagem Inversa, consiste em uma busca em banco de dados de estruturas protéicas, sendo estas de relevância farmacológica, de maneira a evidenciar in silico, os receptores farmacológicos de atuação para um determinado ligante de interesse. A plataforma utilizada denomina-se sc-PDB, o qual é um software on-line que abriga somente alvos farmacológicos, sendo selecionadas a partir do PDB. O principal objetivo deste estudo é realizar o processo de TVI para neurotransmissores cujos receptores encontram-se descritos no PDB. Este estudo preliminar busca validar o método de TVI para uma posterior aplicação em compostos naturais. A estrutura dos neurotransmissores da adrenalina, serotonina e adenosina foram submetidos ao programa on-line sc-PDB. Onze variáveis foram estudadas, cada uma separadamente, mantendo as demais segundo o default do programa. Após esse procedimento foi estabelecido um protocolo, o qual será utilizado na busca de receptores de compostos naturais. Nesse protocolo ficou estabelecido o procedimento que encontra maior número de ligantes, na qual a molécula deve ser gerada sem os seus hidrogênios, sem estereoquímica, definindo como parâmetro de entrada subestrutura, e sem considerar variáveis como número de ligações rotáveis, de anéis ou de grupos doadores e receptores de ligação hidrogênio. 10.5216/ref.v8i1.10561
Referência(s)