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Análise de diversidade e expressão de retrotransposons ativos em espécies de Coffea

2015; Linguagem: Português

2639-6459

Elaine Silva Dias,

Cocoa and Sweet Potato Agronomy

A historia evolutiva das angiospermas e marcada por rapida e ampla diversificacao, cujo background deve-se a acao de numerosos fatores; dentre esses, os elementos de transposicao (TEs) tem sido considerados como um dos agentes mais importantes. TEs podem compor grandes porcoes do genoma de plantas e, dessa forma, desempenhar um papel importante na promocao da diversidade genetica. O objetivo deste estudo foi investigar a dinâmica evolutiva de TEs ativos em especies do genero Coffea. Uma ampla analise da distribuicao e evolucao de um retrotransposon com LTR (LTR-RT), o elemento Copia25, foi realizada em genomas de plantas. Copia25 e amplamente distribuido na familia Rubiaceae, e, esta presente em especies distantemente relacionadas pertencentes as subclasses Asteridae e Rosidae, e a classe das monocotiledoneas. Em particular, foi observada uma incongruencia envolvendo sequencias Copia25 de especies do genero Musa, uma monocotiledonea, e do genero Ixora, uma dicotiledonea (Rubiaceae), que seria devido a um evento de transferencia horizontal (HT) entre essas especies ou entre suas linhagens ancestrais. Copia25 apresenta dinâmica evolutiva complexa em angiospermas, cuja historia incluiria conservacao de sequencias, perdas estocasticas e HT. Dez LTR-RTs foram anotados no genoma de C. canephora e tiveram seus perfis insercionais obtidos, usando os metodos de IRAP e REMAP, em genotipos das especies progenitoras, C. canephora e C. eugenioides, e do alotetraploide, C. arabica. Perdas de insercoes teriam ocorrido no alotetraploide, sendo essas mais significativas em cinco das dez familias investigadas, e observou-se, ainda, a ocorrencia de alteracoes direcionais nos subgenomas, sendo mais frequentes as ocorridas no subgenoma maternal, C. eugenioides. O presente trabalho contribui para o entendimento da evolucao dos LTR-RTs nos genomas, da colonizacao de novos genomas por esses elementos, bem como, da sua dinâmica evolutiva em um genoma recem-originado.