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Artigo Acesso aberto Produção Nacional Revisado por pares
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Estudo Teórico Das Ligações De Hidrogênio no Sítio Catalítico da Enzima Ecdisona via cálculos QM/MM e Campo de Força Clássico

2017; FUNDACAO UNIVERSIDADE FEDERAL DO TOCANTINS; Volume: 4; Issue: 1 Linguagem: Português

10.20873/uft.2359-3652.2017v4n1p130

ISSN

2359-3652

Autores

Daniel Augusto Barra de Oliveira,

Tópico(s)

Enzyme Catalysis and Immobilization

Resumo

O metabólito 20-hidroxiequidisona é responsável por iniciar mudanças nos exoesqueletos de insetos. Esta molécula é também associada com suplementação alimentar e pode ser usada como indutora em pesquisas com transgênicos. Por isso o entendimento do processo bioquímico associado com a interação enzima/molécula é essencial para entender os fenômenos biológicos nos quais a 20-hidroxiequidisona está envolvida. Por essa razão a modelagem molecular é muito importante para o entender quais interações ou ligações são mais importantes para descrever o ancoramento molecular da enzima/molécula. Neste trabalho foram realizados cálculos de otimização de geometria usando a mecânica molecular para a proteína inteira e mecânica molecular/quântica (QM/MM) baseado na aproximação ONIOM. Os resultados destes cálculos foram comparados com os dados experimentais de ligação de hidrogênio provenientes da técnica de difração de raio x. Os cálculos mostram que a combinação ONIOM (B3LYP/UFF) possui maior acurácia que aqueles provenientes unicamente do campo de força Charm para a descrição de ligações de hidrogênio no sítio catalítico.

Referência(s)