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Neonatal screening for severe combined immunodeficiency in Brazil

2016; Elsevier BV; Volume: 92; Issue: 4 Linguagem: Inglês

10.1016/j.jpedp.2016.05.006

2255-5536

Marilia Pyles Patto Kanegae, Lucila Akune Barreiros, Juliana Themudo Lessa Mazzucchelli, Sônia Marchezi Hadachi, Laura Maria de Figueiredo Ferreira Guilhoto, Ana Lúcia Acquesta, I Genov, Silvia Maia Holanda, Regina Sumiko Watanabe Di Gesu, Ana Lúcia Goulart, Amélia Miyashiro Nunes dos Santos, Newton Bellesi, Beatriz Tavares Costa‐Carvalho, Antônio Condino‐Neto,

Cytomegalovirus and herpesvirus research

To apply, in Brazil, the T‐cell receptor excision circles (TRECs) quantification technique using real‐time PCR in newborn screening for severe combined immunodeficiency (SCID) and assess the feasibility of implementing it on a large scale in Brazil. 8715 newborn blood samples were collected on paper filter and, after DNA elution, TRECs were quantified by real‐time PCR. The cutoff value to determine whether a sample was abnormal was determined by ROC curve analysis, using SSPS. The concentration of TRECs in 8682 samples ranged from 2 to 2181 TRECs/μL of blood, with mean and median of 324 and 259 TRECs/μL, respectively. Forty‐nine (0.56%) samples were below the cutoff (30 TRECs/μL) and were reanalyzed. Four (0.05%) samples had abnormal results (between 16 and 29 TRECs/μL). Samples from patients previously identified as having SCID or DiGeorge syndrome were used to validate the assay and all of them showed TRECs below the cutoff. Preterm infants had lower levels of TRECs than full‐term neonates. The ROC curve showed a cutoff of 26 TRECs/μL, with 100% sensitivity for detecting SCID. Using this value, retest and referral rates were 0.43% (37 samples) and 0.03% (3 samples), respectively. The technique is reliable and can be applied on a large scale after the training of technical teams throughout Brazil Aplicar no Brasil a técnica de quantificação de T‐cell Receptor Excision Circles (TRECs) por PCR em tempo real para triagem neonatal de imunodeficiência combinada grave (SCID) e avaliar se é possível fazê‐la em grande escala em nosso país. Foram coletadas em papel filtro 8.715 amostras de sangue de recém‐nascidos e, após eluição do DNA, os TRECs foram quantificados por PCR em tempo real. O valor de corte para determinar se uma amostra é anormal foi determinado pela análise de curva ROC com o programa SSPS. A concentração de TRECs em 8.682 amostras analisadas variou entre 2 e 2.181 TRECs/μL de sangue, com média e mediana de 324 e 259 TRECs/μL, respectivamente. Das amostras, 49 (0,56%) ficaram abaixo do valor de corte (30 TRECs/μL) e foram requantificadas. Quatro (0,05%) mantiveram resultados anormais (entre 16 e 29 TRECs/μL). Amostras de pacientes com diagnóstico clínico prévio de SCID e síndrome de DiGeorge foram usadas para validar o ensaio e todas apresentaram concentração de TRECs abaixo do valor de corte. Recém‐nascidos prematuros apresentaram menores níveis de TRECs comparados com os nascidos a termo. Com o uso da curva ROC em nossos dados, chegamos ao valor de corte de 26 TRECs/μL, com sensibilidade de 100% para detecção de SCID. Com o uso desse valor, as taxas de repetição e encaminhamento ficaram em 0,43% (37 amostras) e 0,03% (3 amostras), respectivamente. A técnica é factível e pode ser implantada em grande escala, após treinamento técnico das equipes envolvidas.