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Artigo Acesso aberto Produção Nacional
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Ferramentas computacionais para a montagem de genomas bacterianos: um estudo comparativo

2023; Servicios Academicos Intercontinentales; Volume: 16; Issue: 10 Linguagem: Português

10.55905/revconv.16n.10-332

ISSN

1988-7833

Autores

Gustavo Jorge Novaes Silva, Matheus Brito De Oliveira,

Tópico(s)

Genetics, Bioinformatics, and Biomedical Research

Resumo

O surgimento das tecnologias de sequenciamento de próxima geração (NGS) revolucionou as técnicas de identificação das bases nitrogenadas do DNA, impulsionando a pesquisa científica global, especialmente na análise genética de bactérias. A etapa posterior ao sequenciamento - a da montagem computacional dos fragmentos de DNA - é um processo complexo e altamente dependente das plataformas em que os organismos foram sequenciados. Isso levou à proliferação de softwares de montagem genômica com diferentes configurações e parâmetros de funcionamento. A escolha correta dessa ferramenta é crucial para o sucesso da pesquisa, mas a falta de informações atuais sobre o desempenho delas dificulta uma seleção. Este estudo avalia sete ferramentas comumente utilizadas para a montagem de genomas bacterianos, usando amostras biológicas obtidas do repositório Sequence Read Archive (SRA) e sequenciadas na plataforma Ion Personal Genome Machine (IonPGM). O objetivo é fornecer informações abrangentes sobre o desempenho de cada ferramenta, usando várias métricas e parâmetros de qualidade. O estudo visa ajudar os profissionais de bioinformática a escolher a ferramenta adequada para seus projetos e avançar nas técnicas de montagem de genomas bacterianos e na pesquisa científica na área.

Referência(s)