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Mycobacterium tuberculosis Beijing in the State of Nuevo Leon, Mexico

2024; Elsevier BV; Linguagem: Espanhol

10.1016/j.ram.2023.12.007

1851-7617

Nohemí Catana-Botello, Pola Becerril-Montes, Jorge Castro‐Garza, Francisco González‐Salazar, Horacio Almanza‐Reyes, María De Los Ángeles Del Bosque-Moncayo, Alejandro Morales-Vargas, Víctor Manuel Velázquez-Moreno,

Infectious Diseases and Tuberculosis

Tuberculosis remains a serious threat to human health as an infectious disease in Mexico. Data about the genotypes of circulating Mycobacterium tuberculosis isolates (MTB) in the State of Nuevo Leon, Mexico are scarce. We aimed to determine the genotypes of circulating MTB belonging to the Beijing lineage recovered from patients in the State of Nuevo Leon, Mexico. A total of 406 MTB isolates from this state were genotyped using the spoligotyping method and 18-locus MIRU-VNTR. Lineage classification and MTB transmission analysis were performed. Based on the spoligotyping analysis, we found 24 strains belonging to the Beijing genotype that were characterized phylogenetically. The MIRUs showed greater discriminatory power than the standard RFLP-IS6110 method; therefore, the greatest allelic diversity among the Beijing strains was observed with MIRU10, MIRU31, MIRU39, MRU40, and MIRU 26. MVLA analysis showed a profile variation between Beijing and non-Beijing strains. The minimum spanning tree (MST) showed that 79% (19) of the strains are related. All Beijing strains exhibited the deletion of region TbD1, which is a characteristic of modern strains. The application of spoligotyping and MIRU-VNTR-18 methods together proved to be more sensitive, discriminatory, and rapid than the standard method for the epidemiological analysis of Mycobacterium Beijing isolates. This study is one of the first to describe the genomic diversity of M. Beijing in the State of Nuevo Leon, Mexico. La tuberculosis sigue siendo una grave amenaza para la salud humana como enfermedad infecciosa en México. Los datos sobre los genotipos de los aislados de Mycobacterium tuberculosis (MTB) circulantes en el estado mexicano de Nuevo León son escasos. Nuestro objetivo fue determinar los genotipos circulantes de MTB pertenecientes al linaje Beijing recuperados de pacientes en ese estado. Un total de 406 aislamientos de MTB del estado de Nuevo León, México, fueron genotipados con el método espoligotipado y MIRU-VNTR de 18 locus. Se realizaron clasificación de linaje y análisis de transmisión de MTB. Con base en el análisis de espoligotipado, encontramos 24 cepas pertenecientes al genotipo Beijing y se caracterizaron filogenéticamente. Los MIRU mostraron un mayor poder discriminatorio que el método estándar de RFLP-IS6110, mayor diversidad alélica entre las cepas de Beijing se observó con MIRU10, MIRU31, MIRU39, MRU40 y MIRU 26. El análisis de MVLA mostró una variación de perfil entre las cepas de Beijing y no Beijing. El árbol de expansión mínima (MST) mostró que el 79% (19) de las cepas están relacionadas. Todas las cepas de Beijing tenían la deleción de la región TbD1, característica de las cepas modernas. La aplicación de los métodos de espoligotipado y MIRU-VNTR-18 en conjunto resultó ser más sensible, discriminatoria y rápida que el método estándar para el análisis epidemiológico de aislamientos de Mycobacterium Beijing. Este estudio es uno de los primeros en describir la diversidad genómica de Mycobacterium Beijing en el Estado mejicano de Nuevo León.